Es la conversión, efectuada por las bacterias nitrificantes del suelo, de los compuestos orgánicos de nitrógeno, como los aminoácidos y proteínas o la úrea, en nitratos inorgánicos asimilables por las plantas verdes. Intervienen varias bacterias en las distintas fases del proceso. Es de sumo interés, ya que recicla el nitrógeno y lo vuelve a disponer para ser utilizado por los productores fotosintetizadores.